Ерш Балони является относительно недавно (в 1974 г.) описанным видом,
близкородственным с ершом обыкновенным; для него характерны аналогичные
общебиологические и экологические характеристики. Согласно
палеонтологическим и анатомическим исследованиям эволюционно ерш
дунайский происходит именно от ерша обыкновенного.
Изначально считалось, что ареал ерша дунайского ограничивается
исключительно бассейном Дуная. Но в конце 80-х — в начале 90-х годов ХХ
столетия эта рыба была обнаружена также и в средней части бассейна
Днепра: в Кременчугском и Каневском водохранилищах, а также в притоках
Днепра — Десне и Припяти. Таким образом, в пределах Украины ареал ерша
дунайского представлен двумя изолированными территориями: низовье Дуная
и среднее течение Днепра; допускается, что этот вид может проживать
также и в украинской части бассейна притока Дуная — р. Тисса, но
достоверных находок в этом регионе до сих пор не сделано.
Ерш дунайский является видом, который находится под угрозой
исчезновения, и он включен к Красную книгу Международного Союза Охраны
Природы (издание 2000 года).